本书共分三部分，第一部分为概述，主要介绍图们江流域概况，内容包括自然地理、气象水文、经济社会和生态环境；图们江水生生物多样性调查（包括调查原则、调查方法、流程和主要结果）。第二部分主要展示图们江常见水生生物的图鉴及分类特征，内容涵盖藻类、大型底栖动物、鱼类、两栖动物、爬行动物和大型植物。第三部分为附录，提供了物种的名录与分布。
本书适合流域水生态监测与评价、流域水生生物多样性保护、流域渔业资源养护等相关领域的科研和管理人员参考阅读。